簡(jiǎn)要描述:艱難梭狀芽孢桿菌探針法熒光定量PCR試劑盒艱難梭狀芽孢桿菌(Clostridium difficile)屬厭氧性細(xì)菌,一般寄生在人的腸道內(nèi)。
詳細(xì)介紹
品牌 | YLKBIO | 貨號(hào) | YLK10380P |
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規(guī)格 | 50T | 供貨周期 | 現(xiàn)貨 |
主要用途 | 科研實(shí)驗(yàn) | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 化工,生物產(chǎn)業(yè) |
英文名稱 | Clostridium Difficile Probe PCR Kit | 保存條件 | 低溫運(yùn)輸,-20℃保存 |
有效期 | 12個(gè)月 | 試劑盒說明 | 不同批號(hào)的試劑盒組分不可交互使用 |
艱難梭狀芽孢桿菌探針法熒光定量PCR試劑盒
商品名稱:艱難梭狀芽孢桿菌探針法熒光定量PCR試劑盒
Name :Clostridium Difficile Probe PCR Kit
艱難梭狀芽孢桿菌(Clostridium difficile)屬厭氧性細(xì)菌,一般寄生在人的腸道內(nèi)。如果過度服用某些抗生素,艱難梭菌的菌群生長(zhǎng)速度加快,影響腸道中其他細(xì)菌,引發(fā)炎癥。該細(xì)菌會(huì)引起偽膜性腸炎,臨床表現(xiàn)為腹瀉、腹痛、伴有全身中毒癥狀,癥狀突然開始,并伴隨血壓低,嚴(yán)重時(shí)能致死。通常還伴有發(fā)燒,白細(xì)胞增多,之后可導(dǎo)致死亡,是很嚴(yán)重的一類疾病。該細(xì)菌還會(huì)引起抗生素相關(guān)性腹瀉,在體內(nèi)的潛伏期為5-10天,之后導(dǎo)致大量的棕色或水狀腹瀉,持續(xù)1周左右。除上述疾病外,艱難梭菌尚可引起腎盂腎炎、腦膜炎、腹腔及陰道感染、菌血癥和氣性壞疽等。近年來該菌已成為醫(yī)院內(nèi)感染的病原菌之一,日益被人們所重視,因此快速檢測(cè)艱難梭狀芽孢桿菌具有重要意義。熒光定量PCR是檢測(cè)傳染性疾病的主流技術(shù),本產(chǎn)品就是以染料法熒光定量PCR技術(shù)為基礎(chǔ)開發(fā)的專門檢測(cè)艱難梭狀芽孢桿菌的試劑盒,它具有下列特點(diǎn):
1. 即開即用,用戶只需要提供樣品DNA模板。
2. 引物和探針經(jīng)過優(yōu)化,靈敏性高。
3. 提供陽(yáng)性對(duì)照,便于區(qū)分假陰性樣品。
4. 特異性高,引物是根據(jù)人艱難梭狀芽孢桿菌高度保守的VP1區(qū)設(shè)計(jì),不會(huì)跟其他微生物的DNA發(fā)生交叉反應(yīng)。
5. 本產(chǎn)品足夠50次20μL體系的探針法熒光定量PCR反應(yīng)。
6. 本產(chǎn)品只能用于科研。
【試劑組成】
成分 | 十孔盒包裝 |
2×Probe qPCR MagicMix | 0.5 mL(本色蓋) |
熒光PCR專用模板稀釋液 | 1 mL(黃蓋) |
艱難梭狀芽孢桿菌PCR引物 | 100 μL(白蓋) |
艱難梭狀芽孢桿菌qPCR探針 | 100 μL(棕色管) |
艱難梭狀芽孢桿菌陽(yáng)性對(duì)照2.0 (1×10E8拷貝/μL) | 50 μL(紅蓋) |
DNA釋放劑試用裝 | 50次(試用裝) |
使用手冊(cè) | 1份 |
【儲(chǔ)存條件及有效期】
低溫運(yùn)輸,-20℃保存,保存期限為 12 個(gè)月。
【自備試劑】樣品 DNA。
【使用方法】
一、稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品(以10E2-10E7拷貝/μL這6個(gè)10倍稀釋度為例)。由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽(yáng)性對(duì)照,只提供無傳染性的DNA片段作為陽(yáng)性對(duì)照。
1. 標(biāo)記6個(gè)離心管,分別為7,6,5,4,3,2。
2. 用帶芯槍頭分別加入45 μL熒光PCR專用模板稀釋液,最好用帶芯槍頭,下同)。
3. 在7號(hào)管中加入5 μL 1×10E8拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照(試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得1×10E7拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
4. 換槍頭,在6號(hào)管中加入5 μL 1×10E7拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E6拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭,在5號(hào)管中加入5 μL 1×10E6拷貝/μL 的陽(yáng)性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E5拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
6. 重復(fù)上面的操作直到得到6個(gè)稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
二、樣品DNA的制備
7. 如果有N個(gè)樣品,最好設(shè)置N+2個(gè)提取,多出的一個(gè)是PC(樣品制備陽(yáng)性對(duì)照),一個(gè)是NC(樣品制備陰性對(duì)照)??梢杂?span>10μL陽(yáng)性對(duì)照的10000倍稀釋液再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為PC。另外用水作為NC。
8. 用自選方法純化樣品的DNA,本試劑盒跟市場(chǎng)上大多數(shù)細(xì)菌DNA/提取試劑盒兼容。
三、Probe qPCR反應(yīng)(20μL體系,在樣品制備室進(jìn)行)
9. 如果只做1次重復(fù),則標(biāo)記N+9個(gè)PCR管,其中N+2個(gè)用于上步得到的N+2個(gè)樣品,1個(gè)用于PCR陰性對(duì)照,6個(gè)用于標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。
10. 在標(biāo)記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對(duì)照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照,并且陽(yáng)性對(duì)照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲(chǔ)存好后最后加):
成分 | 樣品管 N+2個(gè) | PCR陰性對(duì)照管 | 標(biāo)準(zhǔn)曲線 樣品管(2-7管) |
2×Probe qPCR MagicMix(本色蓋) | 10 μL | 10 μL | 各10 μL |
艱難梭狀芽孢桿菌 qPCR探針(綠蓋) | 2 μL | 2 μL | 各2 μL |
艱難梭狀芽孢桿菌 PCR引物混合液(白蓋) | 2 μL | 2 μL | 各2 μL |
待測(cè)樣品DNA模板 | 6 μL | 不加 | 不加 |
第7步所得標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品稀釋液(2-7號(hào)) | 不加 | 不加 | 各6μL(2號(hào)樣到2號(hào)管,3號(hào)樣到3號(hào)管…) |
11. 蓋上蓋子后上機(jī),按下面參數(shù)進(jìn)行PCR:
過程 | 溫度 | 時(shí)間 |
預(yù)變性 | 94℃ | 5 min |
PCR反應(yīng) (40個(gè)循環(huán)) | 94℃ | 0.5 min |
50℃ | 0.5 min(采集FAM通道的熒光信號(hào)) | |
72℃ | 0.5 min | |
最后延伸 | 72℃ | 10 min |
五、數(shù)據(jù)處理
12. 以陽(yáng)性對(duì)照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測(cè)樣品的Ct值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品DNA濃度的log值,再推算出其濃度。
六、電泳檢測(cè)
13. 如果有必要電泳確認(rèn),可取10-20μL PCR產(chǎn)物直接在瓊脂糖凝膠上電泳產(chǎn)物的大小為400 bp。但電泳非常容易污染實(shí)驗(yàn)環(huán)境,建議不輕易采納。
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