簡(jiǎn)要描述:偷死野田村病毒染料法熒光定量RT-PCR試劑盒偷死野田村病毒(Covert Mortality Nodavirus,CMNV)是一種RNA病毒,主要感染對(duì)蝦,常出現(xiàn)蝦頭發(fā)黑死亡,會(huì)通過水質(zhì)橫向傳播,對(duì)養(yǎng)殖業(yè)危害巨大,因此靈敏快捷的診斷產(chǎn)品具有重要的意義。本產(chǎn)品基于PCR原理開發(fā)。
詳細(xì)介紹
品牌 | YLKBIO | 貨號(hào) | YLK10369P |
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規(guī)格 | 50T | 供貨周期 | 現(xiàn)貨 |
主要用途 | 科研實(shí)驗(yàn) | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 化工,生物產(chǎn)業(yè) |
英文名稱 | Covert Mortality Nodavirus(CMNV) SYBR qRT-PCR Kit | 保存條件 | 低溫運(yùn)輸,-20℃保存 |
有效期 | 12個(gè)月 | 試劑盒說明 | 不同批號(hào)的試劑盒組分不可交互使用 |
偷死野田村病毒染料法熒光定量RT-PCR試劑盒
商品名稱:偷死野田村病毒染料法熒光定量RT-PCR試劑盒
Name :Covert Mortality Nodavirus(CMNV) SYBR qRT-PCR Kit
偷死野田村病毒(Covert Mortality Nodavirus,CMNV)是一種RNA病毒,主要感染對(duì)蝦,常出現(xiàn)蝦頭發(fā)黑死亡,會(huì)通過水質(zhì)橫向傳播,對(duì)養(yǎng)殖業(yè)危害巨大,因此靈敏快捷的診斷產(chǎn)品具有重要的意義。本產(chǎn)品基于PCR原理開發(fā)。它具有下列特點(diǎn):
1. 一站式,用于不需要單獨(dú)準(zhǔn)備每種成分,包括引物和對(duì)照。
2.根據(jù)偷死野田村病毒的保守基因序列設(shè)計(jì)的引物,具有良好的特異性。
3.基于染料法qRT-PCR檢測(cè),靈敏度比常規(guī)RT-PCR高10-100倍,可以達(dá)到至少1000拷貝/反應(yīng)。
4.使用一管式qRT-PCR技術(shù),RT和PCR兩步在一個(gè)試管內(nèi)完成,不需要中間轉(zhuǎn)移樣品,降低了操作誤差和可能的污染。
5.本產(chǎn)品足夠50次30μL體系的RT-PCR,只能用于科研,不能用于臨床。
【試劑組成】
成 份 | 十孔盒包裝 |
2×qRT-PCR 緩沖液 | 500 μL(棕色管) |
10×qRT-PCR酶混合液 | 100 μL(紅蓋) |
ROX染料I | 50 μL(棕色管) |
ROX染料II | 50 μL(棕色管) |
熒光PCR專用模板稀釋液 | 1mL(亮黃蓋) |
偷死野田村病毒RT-PCR引物混合液 | 100 μL(白蓋) |
偷死野田村病毒RT-PCR陽性對(duì)照 (1×10E8拷貝/μL) | 50 μL(黃蓋) |
核酸釋放劑試用裝 | 20次(1mL,綠蓋) |
使用手冊(cè) | 1份 |
【儲(chǔ)存條件及有效期】
低溫運(yùn)輸,-20℃保存,保存期限為12個(gè)月。陽性對(duì)照需要因易污染其他成分需要單獨(dú)放置。本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對(duì)照,只提供RNA片段作為陽性對(duì)照。
【自備試劑】樣品RNA
【使用方法】
一、稀釋陽性對(duì)照(以10E2-10E7這6個(gè)10倍稀釋度為例。由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原。
1. 標(biāo)記6個(gè)離心管,分別為7,6,5,4,3,2。用帶芯槍頭分別加入45 μL 熒光PCR專用模板稀釋液,最好用帶芯槍頭,下同)。
2. 在7號(hào)管中加入5 μL 1×10E8拷貝/μL 的陽性對(duì)照(本試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得1×10E7拷貝/μL的陽性對(duì)照。放冰上待用。
3. 換槍頭,在6號(hào)管中加入5 μL 1×10E7拷貝/μL 的陽性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E6拷貝/μL的陽性對(duì)照。放冰上待用。
4. 換槍頭,在5號(hào)管中加入5 μL 1×10E6拷貝/μL 的陽性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E5拷貝/μL的陽性對(duì)照。放冰上待用。重復(fù)上面的操作直到得到6個(gè)稀釋度的陽性對(duì)照。放冰上待用。
二、樣品RNA的制備
5. 如果有N個(gè)樣品,必須設(shè)置N+2個(gè)提取,多出的一個(gè)是PC(樣品制備陽性對(duì)照),一個(gè)是NC(樣品制備陰性對(duì)照)??梢杂?span>10μL上步制備的陽性對(duì)照梯度稀釋液中的第4號(hào)(濃度為1×10E4拷貝/μL,10μL相當(dāng)于1萬拷貝)再加上一定量的水作為制備的陽性對(duì)照(加水后其總體積跟樣品一樣,樣品體積多少取決于所用試劑盒的要求)??梢杂盟鳛橹苽涞年幮詫?duì)照。
6. 用自選方法純化N+2個(gè)樣品的RNA,本試劑盒跟市場(chǎng)上大多數(shù)病毒RNA提取試劑盒兼容。
三、設(shè)置RT-PCR反應(yīng)(20μL體系,在樣品制備室進(jìn)行)
如果做定量分析并且只做1次重復(fù),則標(biāo)記N+9個(gè)PCR管,其中N+2個(gè)用于上步得到的N+2個(gè)樣品,1個(gè)用于PCR陰性對(duì)照,6個(gè)用于標(biāo)準(zhǔn)曲線。如果做定性分析,并且只做1次重復(fù),則標(biāo)記N+4個(gè)PCR
7. 管,其中N+2個(gè)用于上步得到的N+2個(gè)樣品,1個(gè)用于PCR陰性對(duì)照(用水做模板),1個(gè)用于PCR陽性對(duì)照(用第4號(hào)陽性對(duì)照稀釋液做模板)。下面只描述定量分析的步驟,定性分析只是把6個(gè)標(biāo)曲反應(yīng)縮減成1個(gè),其余不變。
8. 在標(biāo)記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對(duì)照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽性對(duì)照,陽性對(duì)照樣品要等所有管子蓋上蓋子后最后加):
成分 | N+2個(gè)制備所得樣品 | RT-PCR陰性對(duì)照 | RT-PCR陽性 對(duì)照(2-7管) |
2×qRT-PCR 緩沖液 | 10μL | 10μL | 各10μL |
口蹄疫病毒RT-PCR 引物混合物 | 2μL | 2μL | 各2μL |
50×ROX (見注) | 0.4μL | 0.4μL | 各0.4μL |
樣品制備所得RNA模板(來于第8步) | 5.6μL | 不加 | 不加 |
稀釋所得6個(gè)陽性對(duì)照(來于第6步) | 不加 | 不加 | 各5.6μL(2號(hào)樣到2號(hào)管,3號(hào)樣到3號(hào)管…) |
10×qRT-PCR 酶混合液 | 2μL | 2μL | 2μL |
不需要使用ROX的機(jī)型:Thermal Cycle Dice Real Time System, LightCycler、Smart Cycler System、Agilent Mx3000P、RotorGene 3000、RotorGene 6000。
9. 上機(jī)后按下面參數(shù)進(jìn)行RT-PCR(參數(shù)可能會(huì)因儀器不同而需優(yōu)化)。
過程 | 溫度 | 時(shí)間 |
RT(逆轉(zhuǎn)錄) | 50℃ | 15-30分鐘 |
預(yù)變性 | 94℃ | 2分鐘 |
RT - PCR反應(yīng) (30個(gè)循環(huán)) | 95℃ | 15 秒 |
60℃ | 15 秒(采集FAM通道的熒光信號(hào)) | |
72℃ | 15 秒 | |
按儀器預(yù)設(shè)程序進(jìn)行溶解曲線分析 |
四、數(shù)據(jù)處理
10. 如果把本試劑盒用于定量檢測(cè),則以陽性對(duì)照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測(cè)樣品的Ct值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品RNA濃度的log值,再推算出其濃度。
11. 如果把本試劑盒用于定性檢測(cè),只判斷陽性或陰性,則陰性對(duì)照Ct必須大于或等于40。陽性對(duì)照必須有熒光對(duì)數(shù)增長(zhǎng),有典型擴(kuò)增曲線,Ct值應(yīng)該小于或等于30。對(duì)待測(cè)樣品,如果其Ct大于或等于40則為陰性,如果小于或等于35則為陽性。如果在35-40之間,則重復(fù)一次。重復(fù)實(shí)驗(yàn)的Ct值如果大于或等于40則為陰性,如果小于40,則為陽性。
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